مقدمه: پیش بینی میکروRNAهای مرتبط با ژن های هدف با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، موجب صرفه جویی در وقت و هزینه های بررسی آزمایشگاهی می شود. در این مطالعه، پیش بینی ژن های هدف میکروRNAهای مرتبط با بیماری آلزایمر توسط ابزارهای بیوانفورماتیکی مختلف با داده های تجربی گزارش شده مقایسه شد. روش: 41 میکروRNA که بر اساس نتایج آزمایشگاهی گزارش شده در مقالات موجب تغییر در بیان 21 ژن اصلی دخیل در بیماری آلزایمر شده بودند، انتخاب گردید. سپس پیش بینی ژن هدف برای هر میکروRNA به وسیله سه ابزار بیوانفورماتیکی شامل MirTarget، TargetScan و Diana-microT انجام شد و نتایج به دست آمده برای هر سه ابزار با توجه به ژن های هدف گزارش شده برای آن ها با یکدیگر مقایسه گردید. نتایج: در بررسی 41 میکروRNA گزارش شده برای 21 ژن دخیل در بیماری آلزایمر، ابزار MirTarget در 66 درصد، TargetScan در 61 درصد و Diana-microT در 27 درصد از موارد اتصال میکروRNAهای مورد نظر را به ژن هدف، تایید نمود؛ اما اتصال 22 درصد از میکروRNAها به ژن های هدف، توسط هیچ کدام از ابزارها تایید نشد. نتیجه گیری: ابزارهای MirTarget و TargetScan نسبت به Diana-microT در پیش بینی ژن هدف میکروRNAهای دخیل در بیماری آلزایمر توانایی بالاتری دارند. با توجه به الگوریتم به کار گرفته شده در MirTarget، این ابزار بیوانفورماتیکی در پیش بینی ژن های هدف میکروRNAها نتایج عملکردی و واقعی تری را ارایه می کند و به عنوان یک نرم افزار کاربردی در پیش بینی اهداف میکروRNAها توصیه می شود. همچنین می توان نتیجه گیری نمود که تغییرات بیان ژن گزارش شده با واسطه میکروRNAها در بیماری آلزایمر، در مواردی نیاز به بررسی بیشتر دارند.

زمینه و هدف لوسمی لنفوسیتی مزمن شایع ترین لوسمی در بزرگسالان است که حدود 25 تا 30 درصد از کل لوسمی ها را شامل می شود. از علل مهم اتیولوژیک این لوسمی می توان به اختلال در مسیر پیام رسانی NF-kB اشاره کرد. دو پروتئین APRIL و BAFF با تاثیر در مسیر پیام رسانی NF-kB در بیماری زایی این لوسمی ایفای نقش می کنند. بنابراین در مطالعه پیش رو با توجه به اثر تنظیمی miRNA ها در بسیاری از فرایندهای سلولی، به پیش گویی miRNAهای شاخص هدف گیرنده ترانسکریپت های مربوط به APRIL و BAFF با استفاده از نرم افزار های بیوانفورماتیکی مختلف و اختصاصی پرداخته شد. مواد و روش ها بعد از دریافت توالی پروتئین های APRIL و BAFF از سایت NCBI، با کمک پایگاه های بیوانفورماتیکی miRanda، TargetScan، miRWalk، DIANA و miRDB با الگوریتم های متفاوت به بررسی و پیش گویی miRNA های هدف گیرنده ژن های مذکور پرداخته شد. ملاحظات اخلاقی این مطالعه در کمیته اخلاق دانشگاه علوم پزشکی اراک تصویب شده است. یافته ها درنهایت بر اساس امتیازدهی توسط نرم افزارهای بیوانفورماتیک مذکور و بالاتربودن امتیاز و هدف گیری مناسب تر، has-miR-145-5p و has-miR-185-5p به عنوان miRNA های هدف گیرنده ژن APRIL و همچنین has-miR-424 و has-miR-497 به عنوان miRNA های هدف گیرنده ژن BAFF معرفی و برای فاز مطالعات عملی آینده انتخاب شدند. نتیجه گیری با توجه به نقش مهم ژن های APRIL و BAFF در روند طبیعی مرگ سلولی و تکامل سلول های B به نظر می رسد می توان از این mi-RNA های پیش گویی شده با کمک پایگاه های بیوانفورماتیک با الگوریتم متفاوت به عنوان بیومارکرهای مولکولی تشخیصی در جهت شناسایی بیماران مبتلا به لوسمی لنفوسیتی مزمن سود جست.

لطفا برای مشاهده چکیده به متن کامل (PDF) مراجعه فرمایید.

هدف از تحقیق حاضر تاثیر سه شیوه تمرینی بر بیان ژن TGFB1 و VASH-1 در بافت بطن چپ رت های ویستار بود. مواد و روشها: 40 سر موش ویستار8 هفته ای با میانگین وزن33+237 گرم در محیطی کنترل شده نگهداری و به صورت تصادفی در5 گروه 8 تایی قرار گرفتند. برنامه های تمرینی به مدت 8 هفته و هفته ای 3 جلسه با شدت مشخص بود. تمرینات هوازی شامل 47 دقیقه دویدن با شدت متوسط VO2MAX 65 % بر روی تردمیل بود. تمرین HITشامل دویدن با سرعت 2 متر در دقیقه با شیب فزاینده بر روی نوار گردان و تمرینات HIIT شامل 4 وهله تناوبی شدید با شدت 90تا 100درصد VO2MAX و چهار وهله تناوبی کم شدت 50 تا 60 درصد VO2MAX انجام شد. گروه کنترل پایه در هفته اول و پس از استقرار تحت جراحی و بافت برداری قرار گرفت گروه های دیگر پس از آخرین جلسه تمرینی تشریح و سپس بافت قلب آن مورد بررسی قرار گرفت. تغییرات برون گروهی توسط آنالیز واریانس یک راهه و آزمون تعقیبی توکی در سطح معنی داری0/05 ≥ P مورد تجزیه تحلیل قرار گرفت. یافته ها: 1-نتایج نشان می دهد 8 هفته تمرین MIT (001/0 ≥ P)، HIT (001/0≥ P)، HIIT(001/0≥ P) باعث افزایش معنادار بیان TGF-β1در بطن چپ موش های نرویستا ر شد 2-نتایج تحقیق حاضر کاهش معنی دار بیان ژن VASH-1 بین 5 گروه پژوهش نشان می دهد(د(0001/0 (P<. نتیجه گیری: بنظرمیرسد تمرین منظم پتانسیل اثر گذاری در افزایش هایپرتروفی قلب با افزایش TGF-β1 کاهش VASH-1 در رت های نزاد دارد

لطفا برای مشاهده چکیده به متن کامل (PDF) مراجعه فرمایید.

زمینه و هدف سرطان دهانه رحم (CC) سومین بدخیمی شایع در خانم هاست که عمده ترین علت ایجاد آن، ویروس پاپیلومای انسانی (HPV) است. دو انکوژن E6 و E7 این ویروس در روند تومورزایی آن نقش مهمی ایفا می کنند. امروزه، روش های موجود برای غربالگری CC توانایی تشخیص بیماری را در مراحل اولیه ندارند؛ بنابراین، شناسایی بیومارکر های جدید جهت تشخیص به موقع این سرطان حایز اهمیت است. بدین منظور، در مطالعه حاضر، miRNAهای هدف گیرنده دو انکوژن E6 و E7 ویروس پاپیلومای انسانی (تیپ 16 و 18) در CC با روش های بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفتند. مواد و روش ها ابتدا با استفاده از پایگاه NCBI توالی ژن های E6 و E7 برای هر دو تیپ 16 و 18 ویروس پاپیلومای انسانی به دست آمد. سپس با استفاده از پایگاه های بیوانفورماتیکی miRBase و RNA22 مناسب ترین miRNAهای هدف گیرنده ژن های مذکور انتخاب شدند. ملاحظات اخلاقی: این مطالعه در کمیته اخلاق دانشگاه علوم پزشکی اراک تصویب شد. یافته ها با توجه به میزان p-value به دست آمده از پایگاه های بیوانفورماتیکی، miRNAهای (p-value=7/51e-2) miR-92a-5p miR-195-3p (p-value=2. 24e-1)، miR-34a-5p (p-value=2. 73e-1) و miR-155-5p (p-value=4. 95e-2) برای دو ژن E6 و E7 معرفی شدند. نتیجه گیری نتایج حاصل از بررسی های بیوانفورماتیکی نشان داد از بین چهار miRNA شناسایی شده، احتمالا miR-155-5p و miR-92a-5p به ترتیب به عنوان miRNAهای هدف گیرنده اختصاصی ژن های E6 و E7 هستند؛ بنابراین، به نظر می رسد این miRNAها می توانند کاندید مناسبی برای مطالعات آزمایشگاهی در بیماران مبتلا به CC باشند.

سابقه و هدف کمبود گروه های خونی سیستم ABO یکی از مشکلات متداول مراکز انتقال خون در دنیا می باشد. هم ز مان با پیشرفت علم مهندسی ژنتیک و تخلیص پروتیین ها، تبدیل آنتی ژن های A و B به آنتی ژن O و ایجاد گروه خونی واحد مطرح شد. هدف از این پژوهش، بیان ژن آلفا گالاکتوزیداز در میزبان پروکاریوتی E. coli با ایجاد تغییرات پس از ترجمه و در نهایت تبدیل آنتی ژن B گروه خونی به آنتی ژن O بود. مواد و روش ها در این مطالعه تجربی، ژن آلفا گالاکتوزیداز دانه قهوه که پس از بهینه سازی کدون ها در پلاسمید pBHA حاوی جایگاه برش آنزیم های BamH1 و Nco1 کلون شده بود، در باکتری E. coli سویه TOP10 تکثیر و استخراج شد. ژن آلفا گالاکتوزیداز پس از برش با آنزیم های فوق و تخلیص روی ژل آگاروز مجددا در پلاسمید بیانی pET-20b کلون شده و به باکتری E. coli سویه rosetta 2 (DE3) وارد شد. بیان ژن با استفاده از القاکننده IPTG انجام شد. وجود پروتیین تولیدی با استفاده از SDS-PAGE و وسترن بلات بررسی شد. آزمون عملکرد پروتیین نیز با توانایی تبدیل گلبول های B به O ارزیابی شد. یافته ها وسترن بلات و SDS-PAGE وجود پروتیین در پری پلاسم باکتری را تایید کرد. آنزیم تخلیص شده توانست آنتی ژن B را به طور نسبی از گلبول قرمز حذف کرده و میزان آگلوتیناسیون با آنتی سرم B را به میزان زیادی کاهش دهد. نتیجه گیری بیان پروتیین یوکاریوتی در میزبان پروکاریوتی می تواند در تولید انبوه آنزیم گالاکتوزیداز برای کاربرد در مراکز انتقال خون کارگشا باشد. بهینه سازی شرایط مختلف بیان برای دستیابی به مقادیر کافی از آنزیم ضروری می باشد.

به کارگیری روش های کمی پیش بینی در زمینه های مختلف مورد توجه گسترده قرار گرفته است. تغییرات سریع محیط های ناشناخته در دنیای واقعی و به ویژه در بازارهای مالی سبب ایجاد مشکلاتی برای پیش بینی کنندگان برای تامین داده های مورد نیاز شده است. برتری مدل های خاکستری نسبت به مدل های پیش بینی متداول در این است که مدل های خاکستری برای پیش بینی رفتار سیستم نیاز به تعداد کمی داده دارد و نیز رفتار سیستم را بدون دانستن مدل ریاضی آن پیش بینی می کند. هدف از این پژوهش معرفی و استفاده از مدل های پیش بینی خاکستری برای پیش بینی قیمت نفت خام اوپک و مقایسه دقت این مدل ها در پیش بینی قیمت نفت خام می باشد. نتایج حاصله نشان داد که مدل چرخشی و مدل متداول خاکستری، مدل های مناسبی برای پیش بینی قیمت نفت محسوب می شود و از دقت بالایی برخوردار است.